More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5165 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  70 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.82 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  38.32 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  37.96 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.55 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 262 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  36.82 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  34.26 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  34.98 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  33.49 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.2 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  33.66 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 246 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  35.19 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  34.56 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 262 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.93 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  34.7 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  33.66 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.32 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  34.63 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.98 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1616  response regulator receiver  30.28 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.56 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  37.65 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3621  response regulatory protein  35.86 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0192509  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>