More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3237 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  77.93 
 
 		 222 aa  341  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1634  two component LuxR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0598487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  40.5 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 235 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1923  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.177648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  35.84 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  37.3 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  31.48 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  38.18 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  33.49 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.55 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  33.94 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.14 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  33.18 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.1 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  34.1 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 262 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.68 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  32.72 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>