More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1005 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.72 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  41.09 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  40.39 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.91 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  37.69 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.39 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  38.76 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4009  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0669057  normal  0.324745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  38.73 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.41 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 595 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  36.18 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  36.32 
 
 		 592 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  38.83 
 
 		 218 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  36.36 
 
 		 595 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>