More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1870 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
346 aa  676    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.91 
 
 
1045 aa  246  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
378 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 
921 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
657 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
572 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  53.85 
 
 
549 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.38 
 
 
590 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 
529 aa  212  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
691 aa  210  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  51.35 
 
 
541 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  49.36 
 
 
573 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  48.93 
 
 
573 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 
873 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.83 
 
 
546 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
758 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
632 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  50 
 
 
376 aa  202  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.19 
 
 
830 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  49.76 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 
599 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 
590 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 
477 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
580 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
468 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
759 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
649 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  49.25 
 
 
331 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
669 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
875 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  47.21 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  45.5 
 
 
326 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
655 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
370 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
379 aa  175  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
475 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 
1300 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  40.14 
 
 
373 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
570 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
387 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  37.78 
 
 
483 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
685 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
568 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
896 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
627 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  44.49 
 
 
511 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
700 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
386 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
516 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
352 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
389 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
559 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
383 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
671 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  40.64 
 
 
505 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
619 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 
659 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
669 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  34.35 
 
 
945 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3213  two-component hybrid sensor and regulator  26.12 
 
 
359 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  44.24 
 
 
728 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 
479 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
666 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
634 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
905 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 
682 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
759 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  42.94 
 
 
283 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
490 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
503 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
416 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
874 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
553 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  32.45 
 
 
531 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
644 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
769 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.06 
 
 
357 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.84 
 
 
746 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.78 
 
 
637 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
385 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
361 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
401 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
535 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
291 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
492 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
399 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
973 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
789 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3300  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
385 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.85 
 
 
407 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>