More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3337 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
685 aa  1372    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
830 aa  239  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  48.31 
 
 
483 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
378 aa  237  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
590 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
599 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
666 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
642 aa  205  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
478 aa  201  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
590 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
379 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
446 aa  188  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
477 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
758 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
362 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
921 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
570 aa  179  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  41.23 
 
 
373 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
759 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
627 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
546 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
700 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  39.93 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
346 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
1045 aa  163  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  46.94 
 
 
632 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
896 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
516 aa  160  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
873 aa  159  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
991 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
649 aa  157  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 
1265 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  37.38 
 
 
541 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  40.51 
 
 
511 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
603 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
632 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
655 aa  152  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  34.57 
 
 
505 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
732 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
619 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
608 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
691 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
1300 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  51.53 
 
 
700 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
568 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
909 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  49.08 
 
 
712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
875 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
1426 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
580 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  34.39 
 
 
573 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  44.39 
 
 
455 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  34.08 
 
 
573 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
603 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  49.32 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
370 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 
666 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
657 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
475 aa  134  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  35.36 
 
 
326 aa  134  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
352 aa  133  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
1039 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
468 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
1195 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
813 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
1439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
524 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
766 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  29.42 
 
 
849 aa  127  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  34.31 
 
 
331 aa  127  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
1513 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
1425 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
862 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.92 
 
 
769 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  38.71 
 
 
1113 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
1111 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
660 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
773 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 
511 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
383 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
737 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 
773 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
786 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  35.46 
 
 
1969 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
905 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
1253 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.49 
 
 
760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
596 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
500 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
771 aa  114  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  36.68 
 
 
637 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  26.95 
 
 
479 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>