More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1809 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  100 
 
 		 373 aa  733    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 921 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 1045 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  42.91 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 685 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 590 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 666 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 657 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 896 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 529 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 873 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  40 
 
 		 573 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 572 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 632 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  39.64 
 
 		 573 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  42.13 
 
 		 549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 580 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  43.08 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 649 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 700 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 655 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 758 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 691 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 627 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 568 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  41.86 
 
 		 541 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 875 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 477 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  43.14 
 
 		 511 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 1300 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  38.15 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 671 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  37.5 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 830 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 759 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  34.56 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  36.7 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  37.8 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 475 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 559 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 642 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 619 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1064 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 669 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 905 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  30.77 
 
 		 945 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 639 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 525 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  31.91 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 525 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 817 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 551 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 642 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 883 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 785 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  31.82 
 
 		 713 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 673 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 683 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 713 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 793 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 761 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 838 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 526 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 761 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 1532 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 704 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 1195 aa  89.7  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 789 aa  89.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 952 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  23.97 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 786 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  29.39 
 
 		 515 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 729 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  29.52 
 
 		 492 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 626 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  29.21 
 
 		 565 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 1509 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1177 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 769 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>