More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0330 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
758 aa  1526    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
1045 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
921 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
873 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
691 aa  249  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
529 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
1300 aa  230  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
655 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
700 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
378 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.89 
 
 
572 aa  213  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.38 
 
 
590 aa  213  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
370 aa  208  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
599 aa  206  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.24 
 
 
346 aa  205  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 
632 aa  205  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.75 
 
 
657 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 
590 aa  197  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
991 aa  197  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
546 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 
669 aa  194  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  45.37 
 
 
573 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  44.93 
 
 
573 aa  187  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  54.44 
 
 
632 aa  187  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
830 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 
759 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  36.36 
 
 
483 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  35.37 
 
 
511 aa  180  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  49.23 
 
 
331 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
362 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  47.12 
 
 
549 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
570 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  45.89 
 
 
446 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  43.29 
 
 
326 aa  177  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  48.51 
 
 
392 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
446 aa  174  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
516 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  45.1 
 
 
541 aa  170  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  40.64 
 
 
376 aa  168  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
379 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
875 aa  164  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 
619 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
896 aa  162  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
468 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  40.53 
 
 
373 aa  158  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
649 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
627 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
671 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  32.41 
 
 
505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  43.37 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
559 aa  148  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  39.9 
 
 
945 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
475 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
352 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  50.68 
 
 
700 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
358 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  37.82 
 
 
1113 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
896 aa  133  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 
636 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.58 
 
 
712 aa  131  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
659 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
1439 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
901 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
504 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
1253 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1426 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  25.17 
 
 
952 aa  122  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 
511 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
669 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
603 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
1301 aa  120  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  40.24 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
473 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
608 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
768 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
813 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
763 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
766 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
1039 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
862 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
769 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  31.65 
 
 
1265 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
666 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
1032 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
849 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
1078 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  39.75 
 
 
400 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  35.91 
 
 
376 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
593 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
657 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>