More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2881 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
570 aa  1118    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
590 aa  353  5e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
642 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  34.42 
 
 
549 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
572 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
666 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  33.39 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
559 aa  211  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 
873 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  46.64 
 
 
483 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  31.48 
 
 
573 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  31.48 
 
 
573 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.9 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
379 aa  200  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
691 aa  196  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
641 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
599 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
921 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
632 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
590 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  44.72 
 
 
331 aa  181  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
685 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
758 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
1045 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
546 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
616 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  46.15 
 
 
446 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
478 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  39.85 
 
 
326 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
346 aa  170  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
700 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
477 aa  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  42.57 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
1300 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
529 aa  163  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  46.95 
 
 
392 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
370 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
627 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
669 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
657 aa  157  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  27.48 
 
 
738 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
619 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
446 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
759 aa  153  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
830 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
475 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
569 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
594 aa  151  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
596 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
468 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  41.09 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
649 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
671 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  42.13 
 
 
376 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
655 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
617 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
785 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
875 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  41.67 
 
 
505 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
586 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
1034 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1039 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 
887 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
659 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
618 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  30.47 
 
 
945 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
383 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  28.99 
 
 
582 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
896 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.74 
 
 
598 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
882 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  25.54 
 
 
565 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
358 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.22 
 
 
893 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
669 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
525 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  26.94 
 
 
588 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  36.52 
 
 
713 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
905 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.45 
 
 
546 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  24.39 
 
 
588 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  25.64 
 
 
559 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  26.82 
 
 
737 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.14 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.45 
 
 
741 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.3 
 
 
572 aa  99.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
385 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
496 aa  99.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>