More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1000 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  100 
 
 
582 aa  1150    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
563 aa  229  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
562 aa  229  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
594 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.92 
 
 
598 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.91 
 
 
572 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
596 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
590 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
1039 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.89 
 
 
887 aa  151  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1034 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  31.08 
 
 
559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 
641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1052 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
785 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
593 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
574 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 
617 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
732 aa  134  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
741 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 
738 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
991 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
748 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  34.07 
 
 
557 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
570 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  27.72 
 
 
588 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
663 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.11 
 
 
531 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  35.62 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
708 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
655 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  35.25 
 
 
265 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
603 aa  118  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  21.59 
 
 
565 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  30.4 
 
 
588 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
858 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
1042 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
654 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
438 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.92 
 
 
512 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
689 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
559 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
493 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.48 
 
 
298 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
587 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
351 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
572 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
511 aa  99.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
729 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.53 
 
 
557 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
882 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5581  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  27.75 
 
 
548 aa  97.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
404 aa  97.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
578 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
473 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  28.19 
 
 
588 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  29.64 
 
 
294 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  31.17 
 
 
343 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
483 aa  94.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4864  GGDEF  28 
 
 
532 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  27.27 
 
 
549 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
469 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
426 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
763 aa  90.9  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.21 
 
 
531 aa  90.5  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  32.03 
 
 
322 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 
586 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
579 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
893 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  32.29 
 
 
391 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  31.43 
 
 
387 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  27.47 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  31.37 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1742  putative PAS/PAC sensor protein  25.45 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
739 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 
580 aa  82  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
734 aa  80.5  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  25.45 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
524 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
688 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
785 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4178  response regulator receiver protein  28.24 
 
 
1477 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.450705 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  25.91 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  25.99 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4428  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.95 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.11127  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  25.91 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
885 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>