More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2916 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
691 aa  1372    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
1045 aa  292  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
655 aa  284  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
921 aa  277  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
873 aa  270  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
529 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
758 aa  249  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
1300 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
700 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
478 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
657 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
632 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  47.64 
 
 
376 aa  213  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
378 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  53.77 
 
 
541 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  45.24 
 
 
573 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 
599 aa  211  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  44.84 
 
 
573 aa  210  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 
346 aa  210  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  51.43 
 
 
549 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
572 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  46.46 
 
 
446 aa  200  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  37.74 
 
 
483 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
590 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
570 aa  196  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
370 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 
590 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
546 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 
477 aa  188  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
379 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
362 aa  187  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 
669 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  44.19 
 
 
511 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 
568 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
580 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
875 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
896 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
759 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
649 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
627 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  41.01 
 
 
331 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  41.31 
 
 
326 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
830 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  43.9 
 
 
392 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  39 
 
 
373 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 
619 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
446 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
475 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
671 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
516 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
352 aa  153  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
383 aa  147  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
659 aa  145  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  39.09 
 
 
505 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  38.81 
 
 
945 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  28.61 
 
 
636 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
669 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
666 aa  127  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
739 aa  114  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
642 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
456 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
385 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
905 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
761 aa  108  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
701 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  28.84 
 
 
684 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
412 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
375 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1965 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 
1568 aa  100  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
713 aa  98.2  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
770 aa  97.4  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
401 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
1383 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  34.48 
 
 
672 aa  96.3  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
375 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
968 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
375 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
375 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.31 
 
 
423 aa  94.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
941 aa  93.2  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  24.91 
 
 
749 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  31.25 
 
 
399 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  31.58 
 
 
727 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
816 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  30.83 
 
 
630 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
504 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  33.94 
 
 
713 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
387 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  28.1 
 
 
403 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1331 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
496 aa  91.3  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
449 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
1513 aa  91.3  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
793 aa  91.3  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
973 aa  91.3  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>