More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2693 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  100 
 
 		 399 aa  825    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  50.78 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  49.74 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  49.09 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  46.19 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  31.52 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.1 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.24 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 483 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.63 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.08 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 358 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  32.22 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 451 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.46 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 383 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.54 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.01 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  35.69 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  28.91 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  33.33 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.35 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  32.8 
 
 		 482 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  31.97 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.64 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.03 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 482 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 473 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  33.69 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  33.1 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  33.1 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.1 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.1 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  33.1 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.62 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 470 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.3 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.39 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.26 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.74 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.14 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.6 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.7 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.85 
 
 		 593 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  28.81 
 
 		 514 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 723 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 496 aa  138  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.93 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.41 
 
 		 508 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 488 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 437 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.01 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  31.33 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  30.99 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  32.86 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  34.68 
 
 		 594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  31.15 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 504 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  30.03 
 
 		 592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>