More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1571 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.04 
 
 
1300 aa  820    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
873 aa  1752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
1045 aa  350  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
655 aa  347  6e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
921 aa  332  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
875 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
529 aa  294  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
691 aa  271  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
700 aa  268  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
758 aa  266  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
830 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  36.67 
 
 
483 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
478 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
632 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  30.23 
 
 
636 aa  212  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  53.88 
 
 
446 aa  211  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 
572 aa  209  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  47.67 
 
 
573 aa  209  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 
570 aa  208  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  47.29 
 
 
573 aa  207  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
657 aa  207  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  52.04 
 
 
331 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
590 aa  205  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.58 
 
 
346 aa  205  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  50.21 
 
 
541 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 
590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  51.52 
 
 
392 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
362 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
378 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
896 aa  197  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
546 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
477 aa  193  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
759 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 
568 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  51.47 
 
 
549 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 
669 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
379 aa  189  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
370 aa  188  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
580 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
627 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  27.86 
 
 
684 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 
475 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
599 aa  183  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  44.86 
 
 
326 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 
516 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  41.58 
 
 
511 aa  174  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
649 aa  173  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 
468 aa  173  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  44.13 
 
 
376 aa  172  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 
352 aa  170  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
446 aa  170  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  42.02 
 
 
373 aa  167  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 
619 aa  164  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
383 aa  161  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  37.72 
 
 
505 aa  160  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
603 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
685 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
786 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
671 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
358 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 
1589 aa  147  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
858 aa  144  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
559 aa  144  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
874 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
604 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
1195 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
801 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
1568 aa  138  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  26.21 
 
 
1059 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
817 aa  137  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  26.07 
 
 
1216 aa  137  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
659 aa  137  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
909 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
991 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  23.63 
 
 
801 aa  132  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  23.63 
 
 
801 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
883 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  22.97 
 
 
917 aa  131  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 
737 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  22.74 
 
 
801 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
1052 aa  128  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  38.26 
 
 
945 aa  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
1181 aa  125  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
666 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  23.93 
 
 
952 aa  123  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
642 aa  121  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
456 aa  121  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
1513 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
669 aa  118  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
938 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 
1383 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
905 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
821 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.04 
 
 
578 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 
1428 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1431 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 
591 aa  114  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>