More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2519 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
590 aa  1164    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
570 aa  347  5e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
642 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  38.74 
 
 
549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
572 aa  239  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  35.05 
 
 
541 aa  238  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
580 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
559 aa  230  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 
378 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  33.56 
 
 
573 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  33.39 
 
 
573 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 
921 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.27 
 
 
1045 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
590 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  46.54 
 
 
446 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  45.82 
 
 
483 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 
632 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
873 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
685 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
477 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  52.34 
 
 
511 aa  199  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 
370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
691 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 
758 aa  197  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
619 aa  196  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
468 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
649 aa  196  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 
346 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
379 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
529 aa  195  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 
657 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
568 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
599 aa  194  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  48.46 
 
 
326 aa  193  6e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
478 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
830 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
669 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.02 
 
 
546 aa  191  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
627 aa  190  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
475 aa  190  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  49.53 
 
 
331 aa  187  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
759 aa  183  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
875 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 
655 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
616 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  44.36 
 
 
373 aa  177  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
352 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
1300 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
516 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
641 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
666 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  46.88 
 
 
376 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
896 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
700 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  45.07 
 
 
392 aa  163  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
596 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
593 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
383 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
659 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 
887 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
671 aa  151  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
566 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.57 
 
 
905 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
358 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
562 aa  144  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  40.18 
 
 
505 aa  140  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  34.88 
 
 
945 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
882 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
1039 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  26.17 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 
586 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  34.56 
 
 
713 aa  134  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  23.36 
 
 
565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
669 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
563 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1034 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
893 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  25.46 
 
 
738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  31.56 
 
 
737 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.01 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  24.03 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.45 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 
741 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
860 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.67 
 
 
572 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  30.53 
 
 
621 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.49 
 
 
611 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
618 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
581 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.38 
 
 
512 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
739 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
571 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4428  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.79 
 
 
524 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.11127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>