More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0718 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 649 aa  1277    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 378 aa  212  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 590 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  36.9 
 
 		 446 aa  204  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 830 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  48.52 
 
 		 541 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 875 aa  200  7e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 362 aa  200  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.88 
 
 		 657 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 346 aa  197  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  34.72 
 
 		 713 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 		 921 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 1045 aa  190  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  43.48 
 
 		 573 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  41.51 
 
 		 483 aa  187  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 873 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  43.08 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  44.96 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 632 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 691 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  35.75 
 
 		 392 aa  180  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  35.4 
 
 		 331 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 655 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 685 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 580 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 1300 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 546 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  45.58 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 1052 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 446 aa  173  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 		 896 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  36.41 
 
 		 373 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 516 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 352 aa  171  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  42.04 
 
 		 326 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  45.65 
 
 		 511 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 666 aa  165  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 759 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 370 aa  161  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 627 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 383 aa  157  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 700 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  37.56 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 669 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 642 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 535 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 671 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 659 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 905 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  32.95 
 
 		 945 aa  120  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1909  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.99 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 358 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 559 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  26.86 
 
 		 727 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  27.51 
 
 		 1053 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 385 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  36.67 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  29.76 
 
 		 608 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 525 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 595 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  29.76 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.76 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 525 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  29.76 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  29.76 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 786 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  29.76 
 
 		 608 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 509 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  25.14 
 
 		 590 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 761 aa  98.6  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 499 aa  98.2  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  24.1 
 
 		 595 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  24.58 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  28.1 
 
 		 770 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 430 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 459 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 459 aa  94  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 520 aa  94.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  24.1 
 
 		 595 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 		 636 aa  94  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 656 aa  94  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>