More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0657 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1052 aa  2103    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
1042 aa  233  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
568 aa  191  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
748 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
663 aa  163  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
574 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
655 aa  154  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  39.85 
 
 
559 aa  153  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
579 aa  152  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
654 aa  151  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  36.55 
 
 
294 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  34.88 
 
 
582 aa  142  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
469 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
689 aa  139  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.58 
 
 
598 aa  139  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
587 aa  139  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
472 aa  138  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.25 
 
 
1568 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
603 aa  134  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
483 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  35.65 
 
 
322 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
438 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
493 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
563 aa  132  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
830 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
873 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
351 aa  127  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  33.46 
 
 
588 aa  127  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
594 aa  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
700 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  35.11 
 
 
383 aa  125  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
858 aa  125  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
404 aa  125  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
729 aa  125  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
991 aa  125  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  34.69 
 
 
265 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
734 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
1300 aa  121  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  33.59 
 
 
588 aa  121  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
618 aa  118  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  33.33 
 
 
362 aa  117  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  34.53 
 
 
298 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  34.35 
 
 
557 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
473 aa  115  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  34.4 
 
 
343 aa  115  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
516 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
562 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
883 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
1195 aa  107  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.22 
 
 
572 aa  106  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
983 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 
750 aa  105  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
739 aa  102  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
1807 aa  99.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1154 aa  98.2  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
1589 aa  98.2  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
655 aa  97.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
1064 aa  97.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  31.98 
 
 
337 aa  97.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
578 aa  96.3  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  27.48 
 
 
713 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 
535 aa  95.1  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  31.02 
 
 
350 aa  94.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.68 
 
 
1043 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 
1134 aa  93.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0547  sensory box protein  41.67 
 
 
1214 aa  92  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
426 aa  92  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  30.58 
 
 
391 aa  92  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 
636 aa  91.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
708 aa  91.7  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 
1181 aa  91.3  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3217  signal transduction protein  36.8 
 
 
951 aa  90.9  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00711667  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 
1969 aa  89.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
1532 aa  90.1  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  29.05 
 
 
1216 aa  89  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
841 aa  88.2  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
685 aa  87  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
1085 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.51 
 
 
1068 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
1059 aa  85.5  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 
509 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  31.5 
 
 
590 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1045 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.8 
 
 
677 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
832 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
1267 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 
1028 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
3706 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  26.18 
 
 
387 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 
919 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 
1291 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 
994 aa  79.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>