More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1464 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
663 aa  1336    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
734 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
579 aa  194  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
655 aa  177  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
732 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
1052 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
991 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  23.92 
 
 
853 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
1042 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
689 aa  160  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
599 aa  158  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
587 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
438 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
852 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  25 
 
 
852 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
883 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 
858 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
562 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
743 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  25.75 
 
 
812 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
1050 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  31.52 
 
 
559 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  34.55 
 
 
265 aa  130  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  32.62 
 
 
294 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
830 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 
637 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
493 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
1101 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
472 aa  124  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.15 
 
 
983 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 
1148 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  36.7 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 
982 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.77 
 
 
810 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
603 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
404 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  29.79 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
1093 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
1093 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
594 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  36.49 
 
 
343 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
351 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
1121 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
642 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  28.37 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1029 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.82 
 
 
727 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
793 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.04 
 
 
1053 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
786 aa  107  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.5 
 
 
1561 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
1134 aa  107  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  35.04 
 
 
588 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
426 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  25.24 
 
 
1379 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 
1134 aa  105  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  32.09 
 
 
383 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.87 
 
 
845 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 
652 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
904 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
902 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.94 
 
 
754 aa  102  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.17 
 
 
572 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.08 
 
 
1258 aa  101  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.26 
 
 
1079 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.33 
 
 
845 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1262 aa  101  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  34.55 
 
 
322 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
563 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  33.99 
 
 
387 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  35.02 
 
 
298 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.83 
 
 
981 aa  98.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 
871 aa  98.2  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 
773 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.96 
 
 
1255 aa  97.4  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.53 
 
 
598 aa  95.9  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.16 
 
 
1309 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
590 aa  96.3  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
773 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.09 
 
 
1207 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
483 aa  94.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  23.06 
 
 
749 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
699 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.09 
 
 
744 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
748 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 
660 aa  94  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
630 aa  94  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.73 
 
 
670 aa  94  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  21.9 
 
 
1253 aa  94  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 
784 aa  94  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3217  signal transduction protein  25.89 
 
 
951 aa  94  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00711667  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.33 
 
 
951 aa  94  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
767 aa  94  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
683 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
775 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>