More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3482 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 994 aa  1969    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 919 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 843 aa  327  8.000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.56 
 
 		 564 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.93 
 
 		 637 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 		 677 aa  228  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.74 
 
 		 728 aa  225  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 834 aa  211  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  26.73 
 
 		 982 aa  206  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  25.87 
 
 		 1071 aa  204  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.01 
 
 		 712 aa  198  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.88 
 
 		 700 aa  197  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  25.82 
 
 		 1216 aa  196  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 781 aa  193  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  25.82 
 
 		 896 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  31.08 
 
 		 1081 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  28.86 
 
 		 532 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 		 1059 aa  180  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 		 1969 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 		 952 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  28.68 
 
 		 644 aa  168  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  31.99 
 
 		 991 aa  167  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 1195 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  29.83 
 
 		 1589 aa  154  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  29.36 
 
 		 553 aa  154  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 830 aa  153  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 770 aa  152  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 		 807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  32.27 
 
 		 1073 aa  148  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 		 524 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  27.89 
 
 		 680 aa  146  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  27.86 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 		 537 aa  145  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  28.55 
 
 		 666 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 786 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 1532 aa  131  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.85 
 
 		 598 aa  128  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  30.38 
 
 		 1260 aa  127  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 685 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 875 aa  111  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 883 aa  111  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 546 aa  104  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 810 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.9 
 
 		 1466 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  25.08 
 
 		 1154 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 1064 aa  96.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 991 aa  96.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 767 aa  95.9  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 896 aa  95.5  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 1042 aa  94.7  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 1045 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 759 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 1052 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 		 1068 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 2693 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.87 
 
 		 242 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 379 aa  89.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  33.16 
 
 		 449 aa  89  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 817 aa  88.2  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 792 aa  87.4  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  23.05 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 734 aa  84  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 714 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 1721 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 741 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  25.42 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.44 
 
 		 1629 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.27 
 
 		 233 aa  81.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 1093 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 1093 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.19 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 663 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1289 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 643 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 841 aa  77.4  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 838 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 750 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 1329 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 1079 aa  75.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 		 1791 aa  76.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.76 
 
 		 823 aa  76.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.348272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.83 
 
 		 1680 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.7 
 
 		 1090 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.32 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.7 
 
 		 1090 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 1181 aa  74.7  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 378 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.21 
 
 		 843 aa  74.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 642 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1168 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  22.54 
 
 		 1079 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>