More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0043 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
1216 aa  2431    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  54.27 
 
 
1059 aa  1023    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  32.64 
 
 
952 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 
982 aa  320  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  39.87 
 
 
991 aa  316  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
1969 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
1589 aa  291  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  39.56 
 
 
1154 aa  278  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.05 
 
 
700 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.77 
 
 
712 aa  259  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.39 
 
 
728 aa  245  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 
1081 aa  241  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 
896 aa  235  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  28.61 
 
 
1073 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 
843 aa  211  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 
636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 
684 aa  191  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  26.2 
 
 
750 aa  188  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 
919 aa  183  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.4 
 
 
564 aa  181  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.64 
 
 
637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 
677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 
1071 aa  162  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  31.54 
 
 
532 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  28.91 
 
 
781 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  31.04 
 
 
537 aa  144  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  26.85 
 
 
1260 aa  142  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
737 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  28.98 
 
 
524 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 
553 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
873 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
642 aa  136  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  29.4 
 
 
644 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  29.36 
 
 
680 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
1064 aa  131  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
838 aa  128  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
1300 aa  127  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
951 aa  126  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  28.11 
 
 
834 aa  123  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 
770 aa  121  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
655 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
821 aa  115  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
1383 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.33 
 
 
1054 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
700 aa  113  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  28.34 
 
 
807 aa  112  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
1195 aa  110  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
1045 aa  109  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
633 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
632 aa  105  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 
666 aa  105  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
786 aa  104  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2725  diguanylate cyclase  35.23 
 
 
479 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.443683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
865 aa  102  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
817 aa  101  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  26.57 
 
 
539 aa  100  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  34.8 
 
 
767 aa  99.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.38 
 
 
598 aa  99.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
890 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1126 aa  99.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
478 aa  99  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
921 aa  98.6  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
875 aa  96.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
639 aa  97.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
796 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1415 aa  96.3  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 
866 aa  94.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
1807 aa  94.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
778 aa  94.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 
930 aa  93.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.9 
 
 
507 aa  92  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
440 aa  91.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1478 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 
685 aa  91.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.01 
 
 
947 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  28.2 
 
 
1427 aa  89.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1431 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
529 aa  89.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
1052 aa  89  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.38 
 
 
697 aa  89  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
546 aa  88.6  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.19 
 
 
861 aa  88.2  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 
956 aa  87  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 
906 aa  86.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
776 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.72 
 
 
1101 aa  85.9  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  21 
 
 
1390 aa  85.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.02 
 
 
1629 aa  85.1  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
779 aa  84.7  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1184 aa  84.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.72 
 
 
1051 aa  84.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
896 aa  84  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.96 
 
 
1094 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
1166 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0171  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.89 
 
 
808 aa  82  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000289521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 
1426 aa  82  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
603 aa  81.6  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1166 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
691 aa  80.1  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
734 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>