More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0919 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
404 aa  823    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
438 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
689 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  30.73 
 
 
376 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
654 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
1052 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
657 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
663 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.8 
 
 
298 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  38.64 
 
 
557 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  34.74 
 
 
265 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  35.04 
 
 
322 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
594 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
748 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
472 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  33.96 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  32.9 
 
 
559 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
563 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
1042 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
493 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
632 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
732 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
562 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
1045 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
734 aa  100  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
1359 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
579 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  28.23 
 
 
362 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  32.77 
 
 
588 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.07 
 
 
572 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
1128 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
810 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
603 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
525 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  31.94 
 
 
343 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  29.46 
 
 
582 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
973 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
587 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
1589 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.66 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1039 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  27.5 
 
 
588 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  31.43 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
991 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
1042 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
532 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
532 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
618 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  30.09 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2922  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
1291 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
960 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.62 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
662 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  24.09 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 
729 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5778  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
1568 aa  70.1  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  29.33 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
708 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  27.59 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  30.95 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
464 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
858 aa  66.6  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
590 aa  66.6  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
1181 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  25 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 
1329 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 
691 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
466 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  32.26 
 
 
515 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
525 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2071  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.1 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0183678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
515 aa  63.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
525 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
535 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  23.53 
 
 
385 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
629 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
1300 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
460 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1995  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.447756  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  25.84 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
763 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
659 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1749  ATPase domain-containing protein  28.64 
 
 
602 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>