More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3605 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
438 aa  890    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
689 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
404 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
748 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
655 aa  156  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
663 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
594 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
654 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
574 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  36.52 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
579 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
1052 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
732 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  38.16 
 
 
265 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
469 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
603 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  39.25 
 
 
557 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
563 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
734 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  36.54 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  34.18 
 
 
588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  33.5 
 
 
298 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
1042 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
991 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
562 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.1 
 
 
572 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  34 
 
 
362 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  35.54 
 
 
322 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
493 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.22 
 
 
588 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  33.77 
 
 
582 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
426 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  36.36 
 
 
350 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
858 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  29.03 
 
 
343 aa  93.6  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
618 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  31.22 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  31.34 
 
 
384 aa  90.1  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  33.04 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
793 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.97 
 
 
598 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
511 aa  87.8  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
708 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  26.95 
 
 
779 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
729 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
807 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  28.12 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 
679 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
1181 aa  80.1  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  31.19 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
714 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  25.61 
 
 
746 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.78 
 
 
1359 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.67 
 
 
680 aa  74.3  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
903 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  25.87 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.5 
 
 
582 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  24.08 
 
 
683 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
830 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  35.64 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
1177 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
783 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
671 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.29 
 
 
789 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.8 
 
 
785 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
661 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 
717 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 
637 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.43 
 
 
778 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
717 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  25.63 
 
 
894 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2380  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
568 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56794  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  22.32 
 
 
791 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 
817 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
657 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  25.63 
 
 
894 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  25.63 
 
 
894 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
464 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
697 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  25.91 
 
 
895 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 
778 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.43 
 
 
778 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  23.43 
 
 
778 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>