More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3654 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
689 aa  1393    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
438 aa  326  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  40.6 
 
 
573 aa  280  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  40.6 
 
 
573 aa  280  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1357  histidine kinase A domain protein  36.34 
 
 
550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.126794 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  41.16 
 
 
549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
572 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  37.16 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  35.21 
 
 
541 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
748 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
663 aa  160  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
579 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
654 aa  147  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  40.09 
 
 
265 aa  147  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
708 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
574 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
1052 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
655 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  41.74 
 
 
557 aa  133  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  35.32 
 
 
294 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
563 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
603 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
562 aa  124  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
587 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
1042 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
734 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  34.41 
 
 
559 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
991 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  33.48 
 
 
343 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
732 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  31.06 
 
 
588 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
472 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.11 
 
 
572 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  33.48 
 
 
322 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
516 aa  106  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  29.06 
 
 
362 aa  104  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  29.74 
 
 
582 aa  101  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  27.83 
 
 
298 aa  97.8  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
618 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  29.31 
 
 
387 aa  95.1  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
450 aa  94.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  31 
 
 
337 aa  94.4  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
763 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
426 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.78 
 
 
598 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
590 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
729 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  30.19 
 
 
350 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.6 
 
 
839 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  26.86 
 
 
383 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.8 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
676 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
739 aa  80.9  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
830 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
634 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 
779 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.8 
 
 
1380 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
817 aa  78.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 
679 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  29.68 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.27 
 
 
953 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 
753 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
464 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 
760 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 
633 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
714 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
351 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  28.16 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 
903 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
800 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.11 
 
 
780 aa  74.7  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.27 
 
 
1255 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 
661 aa  74.7  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
682 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  24.78 
 
 
894 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  24.35 
 
 
894 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  24.35 
 
 
894 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  24.35 
 
 
894 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
858 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 
580 aa  73.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.74 
 
 
1172 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  26.91 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
1415 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.81 
 
 
785 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0064  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 
564 aa  72.4  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.29 
 
 
1348 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>