More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1800 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  100 
 
 		 588 aa  1185    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  38.32 
 
 		 549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  35.36 
 
 		 573 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  35.36 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 572 aa  300  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  36.83 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1357  histidine kinase A domain protein  34.17 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.126794 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 689 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  46.15 
 
 		 387 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 991 aa  203  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 483 aa  203  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 858 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 739 aa  158  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  37.99 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 729 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 748 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  27.78 
 
 		 559 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 563 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  33.56 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 741 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  36.84 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  37.99 
 
 		 385 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 562 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 1052 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 390 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 569 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.83 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  27.42 
 
 		 582 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 450 aa  113  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 1568 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 618 aa  108  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 666 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 800 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 574 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.83 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  22.41 
 
 		 565 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 603 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 351 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  29.43 
 
 		 265 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 735 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 628 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 570 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 625 aa  98.2  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  31.47 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1181 aa  97.4  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  29.79 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 838 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1329 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 659 aa  94.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 655 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 559 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 945 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 883 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 474 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1172 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 586 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  28.07 
 
 		 376 aa  90.1  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  29.41 
 
 		 362 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 713 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 793 aa  88.6  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1195 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1042 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 496 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 466 aa  87.4  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 903 aa  87  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 608 aa  87  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 713 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  28.77 
 
 		 343 aa  87  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 493 aa  87  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 920 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 1028 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  29.11 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  35.37 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 629 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 901 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  27.68 
 
 		 913 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  27.63 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  30.48 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>