More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2345 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 629 aa  1263    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.68 
 
 		 625 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.42 
 
 		 628 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  38.6 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 466 aa  232  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.65 
 
 		 807 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 800 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 		 903 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.67 
 
 		 1329 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.71 
 
 		 793 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 781 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 535 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 735 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.89 
 
 		 659 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 		 608 aa  200  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.26 
 
 		 631 aa  194  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 659 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.24 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 592 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 930 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  27.51 
 
 		 628 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 466 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 974 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  31.31 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 523 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 437 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 532 aa  94.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 723 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 516 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 387 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 991 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 835 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 640 aa  91.3  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  29.15 
 
 		 897 aa  90.9  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  30.4 
 
 		 471 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  31.38 
 
 		 895 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  31.38 
 
 		 894 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  31.38 
 
 		 894 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  26.84 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 386 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 725 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 761 aa  88.2  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1497  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 510 aa  87.8  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000624142  hitchhiker  0.000000668265 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.65 
 
 		 588 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  28.02 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  28.45 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  31.25 
 
 		 895 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  30.53 
 
 		 908 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  28.61 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  26.6 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 944 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  29.12 
 
 		 750 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  30.09 
 
 		 908 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  41.51 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  30.09 
 
 		 908 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  27.78 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 838 aa  83.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  27.36 
 
 		 528 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  25.77 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.87 
 
 		 853 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 858 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 944 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  28.74 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 639 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.74 
 
 		 906 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>