More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2343 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 625 aa  1259    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 628 aa  585  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 		 629 aa  555  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  40.59 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.69 
 
 		 1329 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 		 715 aa  257  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.66 
 
 		 800 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.87 
 
 		 464 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  58.45 
 
 		 535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 		 659 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.66 
 
 		 793 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 		 903 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 		 531 aa  229  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 		 807 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 659 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 735 aa  224  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.46 
 
 		 543 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.26 
 
 		 608 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.77 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  36.01 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 592 aa  205  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 781 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 642 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 466 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 930 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  26.82 
 
 		 628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 974 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 991 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 604 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  33.67 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 431 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.56 
 
 		 923 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 546 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 641 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 613 aa  100  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.91 
 
 		 614 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  32.07 
 
 		 770 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 633 aa  98.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 858 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  31.87 
 
 		 750 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 628 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.17 
 
 		 588 aa  98.2  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 838 aa  97.8  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 646 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 835 aa  97.8  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 662 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 431 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  30.57 
 
 		 810 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 1568 aa  96.3  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 437 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 891 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  31.51 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.39 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  24.5 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 917 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 532 aa  94  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  27.24 
 
 		 617 aa  93.6  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.9 
 
 		 614 aa  93.6  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 464 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  27.45 
 
 		 925 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 610 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 708 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  27.17 
 
 		 925 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  32.06 
 
 		 526 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  25.06 
 
 		 534 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  25.07 
 
 		 564 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 543 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 639 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  25.9 
 
 		 528 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  30.65 
 
 		 897 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 730 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  30.2 
 
 		 908 aa  91.3  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 711 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  30.61 
 
 		 908 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  27.84 
 
 		 917 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 729 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.65 
 
 		 906 aa  90.9  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  30.61 
 
 		 908 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2991  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  27.47 
 
 		 385 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 778 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 678 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 		 919 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 789 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  26.39 
 
 		 560 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 467 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 387 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 396 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  30.56 
 
 		 379 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>