More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2205 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
466 aa  946    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
466 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 
576 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
625 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
543 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
1329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 
593 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
608 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
628 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
903 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
629 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
579 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
800 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
735 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
531 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
659 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
793 aa  151  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  38.39 
 
 
605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
659 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
592 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
807 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
477 aa  123  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
590 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
426 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
991 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
618 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
595 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
621 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
850 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
827 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  26.22 
 
 
588 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1055 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
817 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2453  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 
603 aa  84  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704197  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  41.28 
 
 
512 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  27.36 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
601 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 
708 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1175  histidine kinase  39.62 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158069  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
895 aa  80.1  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
606 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.2 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
723 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  23.12 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
678 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
634 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
783 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 
556 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
785 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.15988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  38.06 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  25.37 
 
 
617 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
763 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  30.8 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  25.99 
 
 
860 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
763 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  26.95 
 
 
745 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
1568 aa  77  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
763 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  26.22 
 
 
895 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2356  PAS sensor protein  26.78 
 
 
668 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
829 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  27.46 
 
 
1003 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3129  histidine kinase  28.09 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  29.17 
 
 
908 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
585 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
867 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
1181 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  25.82 
 
 
829 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  29.17 
 
 
908 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  29.17 
 
 
908 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  26.22 
 
 
894 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
748 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
799 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>