More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1707 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
535 aa  1084    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.9 
 
 
659 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
793 aa  375  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 
1329 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
543 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.22 
 
 
807 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.83 
 
 
464 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.85 
 
 
531 aa  249  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.66 
 
 
659 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 
735 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.45 
 
 
625 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.22 
 
 
903 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
466 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
629 aa  207  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
608 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 
628 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
593 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  42.92 
 
 
605 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
592 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
477 aa  150  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
1568 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 
1168 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
991 aa  98.2  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
1181 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  33.64 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
592 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
456 aa  94  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
592 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
708 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.22 
 
 
1287 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
707 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
1557 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
858 aa  88.6  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3296  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
650 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
947 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
401 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 
556 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
473 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 
711 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
662 aa  87.4  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
385 aa  87  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
711 aa  87  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1445  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
576 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0452635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.3 
 
 
617 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
962 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.78 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
761 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
437 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838045  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  26.68 
 
 
700 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  30.04 
 
 
897 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.59 
 
 
575 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1362 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  28.69 
 
 
919 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
763 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
596 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0538  histidine kinase  30.28 
 
 
550 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
763 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  26.84 
 
 
915 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
763 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1039 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.22 
 
 
853 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
945 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  34.08 
 
 
526 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
606 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  26.86 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.17 
 
 
1666 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  28.32 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 
1397 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
929 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.34 
 
 
1871 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
723 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
343 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
590 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
1174 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
389 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  33.61 
 
 
770 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
763 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
770 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>