More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2409 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 592 aa  1198    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 629 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 800 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 793 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.73474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 628 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 593 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 1329 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1707  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 807 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 576 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 659 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 903 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2205  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1528  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 659 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2222  histidine kinase  32.54 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0226681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.55 
 
 		 853 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 641 aa  107  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.25 
 
 		 971 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 1069 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 556 aa  92.8  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 917 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  24.18 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0437  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.7 
 
 		 659 aa  92.8  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 614 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  27.76 
 
 		 561 aa  91.3  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  27.78 
 
 		 470 aa  90.5  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 739 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  24.64 
 
 		 820 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  21.15 
 
 		 729 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 592 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 678 aa  87  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  27.87 
 
 		 350 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  31.05 
 
 		 2312 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  29.95 
 
 		 387 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.54 
 
 		 1022 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 818 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 919 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  29.55 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3141  diguanylate cyclase  23.12 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.673343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  29.2 
 
 		 935 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  23.9 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 827 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.67 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  27.04 
 
 		 464 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  25.47 
 
 		 389 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 920 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  27.56 
 
 		 919 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  27.67 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  27.7 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1023  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1264  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  26.21 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  29.82 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 630 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 639 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 932 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 746 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 920 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  25.94 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  27.01 
 
 		 913 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 818 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 585 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  24.68 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 628 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 909 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 592 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 450 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  24.24 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>