More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5069 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
748 aa  1519    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 
744 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 
744 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
778 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1274 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3542  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
464 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743078  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
853 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3541  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
655 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
384 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
566 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1550 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
763 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
763 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
754 aa  162  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
1977 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
676 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
1252 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
757 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1305 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0561  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
640 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393536  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
792 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
884 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
553 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2135  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
844 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2091  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
844 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 
1285 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.54 
 
 
2017 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
1560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.14 
 
 
734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 
1130 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
714 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  31.15 
 
 
352 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 
1820 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1120  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
577 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
1183 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
928 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
1255 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
838 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
705 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
941 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.44 
 
 
1207 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
1714 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
875 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
633 aa  119  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.94 
 
 
960 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
670 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
1072 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  26.79 
 
 
1055 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
890 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
1808 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
418 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 
1172 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
579 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2189  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
729 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.49015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
906 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.97 
 
 
832 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
556 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.1 
 
 
1262 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
729 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 
729 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
730 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
711 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
668 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
639 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
887 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
887 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
2693 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1195 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3033  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
585 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
556 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1070 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
793 aa  110  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
711 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
458 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
1322 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.78 
 
 
1081 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
723 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1070 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  29.92 
 
 
903 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
706 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
457 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
546 aa  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 
614 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
520 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
610 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1005  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
497 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>