More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1717 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 447 aa  888    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.15988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  34.67 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 953 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 896 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  31.7 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 799 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  33.04 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 819 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 1010 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 450 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 501 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  31.25 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 842 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  30.43 
 
 		 581 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  29.58 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 841 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 581 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 625 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1291 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  27.9 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 663 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 892 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 839 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  29.84 
 
 		 257 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 682 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 799 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  32.49 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  35.43 
 
 		 628 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  25.94 
 
 		 599 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 829 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.41 
 
 		 576 aa  97.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  32.14 
 
 		 553 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  32.07 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3321  histidine kinase  27.8 
 
 		 444 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1808 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 662 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 839 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  33.33 
 
 		 646 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 979 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  28.83 
 
 		 231 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 613 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 880 aa  94.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 350 aa  94.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1173 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3287  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 584 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 593 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  29.31 
 
 		 589 aa  93.2  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1207 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 581 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2733  ATP-binding region ATPase domain protein  27.31 
 
 		 355 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 945 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  27.62 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 488 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  27.73 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  27.73 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  27.73 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 		 639 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1297 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  27.73 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  27.73 
 
 		 587 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 354 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  27.43 
 
 		 587 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1478 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0838  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  33.92 
 
 		 693 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 499 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  27 
 
 		 587 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  27 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  27 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  28.75 
 
 		 360 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 579 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 462 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  28.91 
 
 		 600 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  31.44 
 
 		 498 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>