More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3431 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.11 
 
 		 450 aa  872    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 450 aa  879    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  75.06 
 
 		 455 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 446 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  43.38 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  33.56 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  30.89 
 
 		 471 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.63 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  34.06 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  37.53 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.11 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  34.64 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  32.84 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  32.14 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  32.14 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3934  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  34.87 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  27.15 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  34.55 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.66 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 454 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.89 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  33.33 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  33.33 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  33.11 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  33.33 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.03 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  33.11 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  33.11 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  33.1 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  29.69 
 
 		 487 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 519 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.34 
 
 		 513 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  34.94 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.65 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 440 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 454 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4531  sensor protein QseC  32.82 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0682388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2758  two-component sensor  35.42 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 515 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.57 
 
 		 499 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  37.99 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>