More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0294 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  99.6 
 
 		 498 aa  992    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 498 aa  997    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  80.28 
 
 		 498 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.8 
 
 		 487 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.38 
 
 		 488 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  60.82 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.09 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.09 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  61.29 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.6 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.81 
 
 		 497 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.96 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.99 
 
 		 498 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.67 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.66 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.9 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.13 
 
 		 501 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.79 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  35.13 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 496 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  33.48 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  30.06 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  29.61 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 473 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 453 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  34.75 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 888 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 594 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  35.64 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.37 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.12 
 
 		 496 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.85 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.16 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  35.34 
 
 		 885 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 604 aa  137  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 396 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  27.54 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  28.08 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 589 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  33.2 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 892 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 591 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 600 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  33.11 
 
 		 363 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  37.5 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 483 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 581 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.03 
 
 		 508 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 1162 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 357 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 640 aa  128  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  36.8 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 650 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 603 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  33.45 
 
 		 360 aa  127  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 645 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  29.69 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 604 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 604 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 889 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  28.53 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  28.79 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>