More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0838 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0838  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
461 aa  941    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
456 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
378 aa  186  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
500 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
487 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  38.36 
 
 
617 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
582 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
581 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  39.41 
 
 
646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3684  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
580 aa  146  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.896547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
579 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
613 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
1274 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  25.79 
 
 
709 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
1043 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1207 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  36.28 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.16 
 
 
496 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1253  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
584 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
549 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3287  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
584 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847642  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
932 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
754 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  36.02 
 
 
745 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
530 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1996  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
584 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0327436  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2117  histidine kinase  33.61 
 
 
631 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0208634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
593 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  36.65 
 
 
570 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.57 
 
 
745 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
467 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4375  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
550 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 
701 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
546 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  35.39 
 
 
508 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
730 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1965 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1352 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4666  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
578 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
637 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
763 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  30.65 
 
 
576 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  31.4 
 
 
742 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
902 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
597 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.23 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
1977 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
933 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  32.92 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
760 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1142 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
597 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32 
 
 
539 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
710 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  34.38 
 
 
454 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  30.88 
 
 
603 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
947 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
846 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
634 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3058  phage head-tail adaptor, putative  35.06 
 
 
580 aa  126  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00943131  normal  0.0427518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.4 
 
 
1442 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1163 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
719 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  32.17 
 
 
406 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.7 
 
 
1346 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
965 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
827 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
407 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
592 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
601 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  33.48 
 
 
846 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1165 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
842 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
513 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1168 aa  123  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1431 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
745 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.77 
 
 
1305 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.99 
 
 
1871 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  36.89 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
857 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.21 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
1877 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2544  sensor histidine kinase/response regulator  32.86 
 
 
1019 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>