More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0735 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 841 aa  1707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 		 839 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  83.47 
 
 		 842 aa  1380    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 744 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000123782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 982 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 916 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 1015 aa  194  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1196 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 957 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 738 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 940 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 1177 aa  185  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 1237 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  32.9 
 
 		 691 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.29 
 
 		 1135 aa  181  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 979 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1559 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 1029 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.5 
 
 		 882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 785 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 1578 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 662 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 696 aa  174  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 1287 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1059 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1046 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 1611 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  31.63 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1002 aa  172  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 969 aa  172  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1622 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 919 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  31.71 
 
 		 1209 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 772 aa  171  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 774 aa  171  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 421 aa  170  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 902 aa  170  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  27.01 
 
 		 1439 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1007 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 1195 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.6 
 
 		 823 aa  170  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 		 1374 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 456 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 995 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 947 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  31.15 
 
 		 810 aa  168  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 1271 aa  167  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  30.73 
 
 		 1211 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 916 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.8 
 
 		 1120 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  31.03 
 
 		 1040 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  30.63 
 
 		 1215 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1058 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1191 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 783 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 1029 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 933 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 628 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1165 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 911 aa  164  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 1118 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 617 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1127 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  28.79 
 
 		 685 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1331 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1369 aa  163  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  30.1 
 
 		 1206 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1193 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1193 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1210 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 784 aa  162  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  29 
 
 		 982 aa  161  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 1340 aa  162  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.89 
 
 		 1193 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 1611 aa  162  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 371 aa  161  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 763 aa  161  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 876 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1201 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1258 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  29.98 
 
 		 1213 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 1352 aa  160  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 862 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 657 aa  160  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 		 1313 aa  160  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1022 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 769 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 691 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1128 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  27.04 
 
 		 1028 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  29.71 
 
 		 1212 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 894 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.27 
 
 		 2213 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 989 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1120 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 833 aa  157  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1207 aa  157  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>