More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4428 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  100 
 
 		 693 aa  1344    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.17 
 
 		 708 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  95.99 
 
 		 700 aa  1283    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.23 
 
 		 676 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  88.89 
 
 		 686 aa  1167    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.57 
 
 		 713 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 757 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 752 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 745 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 754 aa  416  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  46.44 
 
 		 647 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 744 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 744 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.29 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 636 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  44.3 
 
 		 650 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.83 
 
 		 1014 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1363 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.95 
 
 		 1322 aa  304  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1069 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 1369 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 928 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  39.56 
 
 		 761 aa  297  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 916 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.42 
 
 		 1135 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1064 aa  290  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 830 aa  290  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 835 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  33.83 
 
 		 819 aa  281  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1131 aa  280  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1126 aa  280  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 784 aa  280  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1550 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 1266 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.84 
 
 		 1407 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 921 aa  277  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 985 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.63 
 
 		 1653 aa  276  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1310 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 1260 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1267 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 770 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.93 
 
 		 852 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 929 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1305 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3018  histidine kinase  39.32 
 
 		 657 aa  272  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 950 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1124 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 925 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1560 aa  271  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.74 
 
 		 1346 aa  271  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 957 aa  271  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1040 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1284 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1255 aa  270  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 739 aa  270  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1622 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1202 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  36.74 
 
 		 727 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 682 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1397 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 812 aa  267  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 912 aa  267  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1313 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1768 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.6 
 
 		 923 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35 
 
 		 1499 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1172 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 801 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  30.26 
 
 		 1287 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 893 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.93 
 
 		 1331 aa  265  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.71 
 
 		 2213 aa  264  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1767 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1767 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1548 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1820 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.39 
 
 		 1763 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1326 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 685 aa  261  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  32.05 
 
 		 765 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.12 
 
 		 1442 aa  260  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.6 
 
 		 1177 aa  260  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1186 aa  260  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1316 aa  260  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 778 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1340 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1203 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 946 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1287 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.12 
 
 		 1179 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 948 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 927 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1118 aa  257  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 936 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  40.61 
 
 		 531 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1033 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  35.75 
 
 		 847 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>