More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1175 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1175  histidine kinase  100 
 
 		 372 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 928 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 641 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 		 969 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 614 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  28.57 
 
 		 483 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 965 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  28.57 
 
 		 483 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 614 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  28.57 
 
 		 483 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  28.57 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 639 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 681 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 639 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 618 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 613 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  25.42 
 
 		 765 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 902 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  27.87 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 595 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 639 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 1291 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1064 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 709 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 799 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 620 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  28.81 
 
 		 1135 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 1550 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 457 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 503 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 874 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 1060 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 969 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.25 
 
 		 456 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 650 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0381  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1169 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 973 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 919 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 631 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  28.69 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  30.09 
 
 		 647 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 602 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 839 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  25.57 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  28.3 
 
 		 544 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 463 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  28.32 
 
 		 810 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.37 
 
 		 871 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 884 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.98 
 
 		 685 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  30.36 
 
 		 905 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  24.51 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  29.57 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 719 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 640 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  29.57 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 504 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 504 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 1433 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 917 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 463 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  28.38 
 
 		 719 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 916 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1057 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 946 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 917 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 829 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 953 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  28.09 
 
 		 906 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 767 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  28.89 
 
 		 917 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.95 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 1043 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 711 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  28.32 
 
 		 894 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.07 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  26.45 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.89 
 
 		 917 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  27.88 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  27.88 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  27.88 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 756 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 		 1207 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.07 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>