More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0413 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 649 aa  1266    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  63.2 
 
 		 636 aa  698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.09 
 
 		 757 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  74.62 
 
 		 650 aa  918    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.41 
 
 		 745 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.12 
 
 		 752 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  59.69 
 
 		 754 aa  591  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.84 
 
 		 700 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  46.29 
 
 		 693 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 686 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.45 
 
 		 708 aa  350  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 744 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 		 676 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 		 713 aa  337  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 744 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 916 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 1014 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1069 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 833 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 893 aa  323  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  40.22 
 
 		 850 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.27 
 
 		 1322 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1369 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.32 
 
 		 929 aa  320  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 929 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1363 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1305 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.56 
 
 		 1135 aa  317  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  39.61 
 
 		 647 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.83 
 
 		 950 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.35 
 
 		 852 aa  310  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1313 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 830 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.01 
 
 		 923 aa  306  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 936 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1064 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 950 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 925 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.55 
 
 		 1177 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.51 
 
 		 941 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  34.43 
 
 		 1407 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 		 1433 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  34.92 
 
 		 918 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1240 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 818 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 928 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1692 aa  299  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 682 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 917 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 816 aa  297  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1771 aa  297  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1202 aa  296  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.92 
 
 		 847 aa  296  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 917 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1767 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1603 aa  296  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 835 aa  296  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1326 aa  296  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1397 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1767 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.08 
 
 		 933 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1820 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.9 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.66 
 
 		 937 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.48 
 
 		 952 aa  294  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 909 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 758 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.08 
 
 		 1765 aa  293  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 917 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1611 aa  293  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.6 
 
 		 1499 aa  293  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 770 aa  293  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1767 aa  293  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  37.17 
 
 		 905 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1005 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.37 
 
 		 933 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.87 
 
 		 1346 aa  291  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.67 
 
 		 906 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.54 
 
 		 933 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.54 
 
 		 932 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  34.22 
 
 		 918 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1480 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.39 
 
 		 1053 aa  289  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 801 aa  289  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.37 
 
 		 933 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1765 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.2 
 
 		 1331 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 921 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 946 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1260 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1165 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  33.9 
 
 		 932 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  36.97 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 		 1763 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 919 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.11 
 
 		 761 aa  287  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 739 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1316 aa  287  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>