More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0184 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  70.66 
 
 		 483 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 481 aa  970    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  70.45 
 
 		 483 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  71.01 
 
 		 481 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  70.66 
 
 		 483 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  70.66 
 
 		 483 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  51.15 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  51.14 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  51.8 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  50.21 
 
 		 474 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  51.69 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  51.27 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  50.84 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  51.56 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  48.56 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  48.87 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  49.48 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  48.87 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  50.32 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  49.48 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  48.67 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  49.18 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  49.06 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  45.91 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  45.7 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  45.91 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  45.91 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  47.18 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  45.91 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  45.91 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  48.43 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  45.7 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  45.7 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  45.49 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  46.92 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  47.38 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.31 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  45.38 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  41.75 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  43.35 
 
 		 486 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  42.86 
 
 		 477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  39.96 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  39.34 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  33.4 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  51.52 
 
 		 239 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  23.23 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  22.11 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  22.11 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  21.9 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  22.11 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  21.9 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.58 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  36.61 
 
 		 591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 457 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  31.37 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1042  histidine kinase  37 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  35.86 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.76 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  26.13 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  33.94 
 
 		 412 aa  123  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 785 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 615 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.7 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  27.11 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  37.44 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.35 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 319 aa  120  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  24.06 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 477 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  33.91 
 
 		 257 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  32.14 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>