More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0317 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
483 aa  950    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  60.49 
 
 
486 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  61.9 
 
 
465 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  46.56 
 
 
483 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  46.56 
 
 
483 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  46.56 
 
 
483 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  47.38 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  46.27 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  46.57 
 
 
481 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  44.56 
 
 
474 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  41.74 
 
 
474 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  43.47 
 
 
474 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  43.53 
 
 
473 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  43.63 
 
 
486 aa  347  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  43.35 
 
 
477 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  44.2 
 
 
478 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  43.88 
 
 
478 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  40 
 
 
481 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  42.74 
 
 
474 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  42.74 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  42.74 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  42.74 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  42.53 
 
 
474 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  42.09 
 
 
472 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  42.13 
 
 
472 aa  332  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  41.25 
 
 
474 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  42.03 
 
 
474 aa  329  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  41.82 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  41.82 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  41.82 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  41.82 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  41.82 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  41.82 
 
 
474 aa  326  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  41.61 
 
 
474 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  42.2 
 
 
474 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  40.37 
 
 
477 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  40.37 
 
 
477 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  40.16 
 
 
472 aa  316  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  40.98 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  37.2 
 
 
475 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  37.29 
 
 
480 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  38.01 
 
 
478 aa  279  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
476 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  36.84 
 
 
494 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  30.51 
 
 
628 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  38.71 
 
 
239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
449 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2562  histidine kinase  27.27 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
538 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  29.72 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.46 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  38.14 
 
 
591 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
453 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
487 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
453 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
467 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
444 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
591 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
587 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  38.12 
 
 
438 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
351 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  33.7 
 
 
471 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
468 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
458 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
357 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
585 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
551 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
351 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
462 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  28.46 
 
 
351 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
497 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
442 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
357 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
458 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
351 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
662 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.79 
 
 
460 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
442 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
517 aa  107  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
640 aa  106  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
460 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
378 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  37.22 
 
 
452 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  38.39 
 
 
391 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
431 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  33.2 
 
 
431 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  24.93 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  24.93 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  24.93 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.88 
 
 
483 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>