More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1712 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  87.73 
 
 
443 aa  799    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
442 aa  912    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  98.64 
 
 
442 aa  902    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  67.58 
 
 
444 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.46 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  60.42 
 
 
437 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.84 
 
 
437 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.53 
 
 
439 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  58.8 
 
 
436 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.49 
 
 
437 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.53 
 
 
439 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.35 
 
 
439 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  58.33 
 
 
436 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  58.33 
 
 
448 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  58.33 
 
 
436 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  59.53 
 
 
439 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  59.3 
 
 
439 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.3 
 
 
439 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  59.3 
 
 
439 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  58.33 
 
 
436 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  58.1 
 
 
436 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  58.33 
 
 
436 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  58.1 
 
 
436 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.24 
 
 
432 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.37 
 
 
460 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.82 
 
 
433 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
449 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 
464 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
476 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
445 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  47.03 
 
 
430 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
431 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.42492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
448 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
465 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
465 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
468 aa  353  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
442 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
454 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0228  histidine kinase  45.02 
 
 
438 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  41.08 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  41 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.12 
 
 
432 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
430 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
432 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
432 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  42.66 
 
 
446 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
439 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
440 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  42.09 
 
 
434 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  42.71 
 
 
437 aa  289  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  40.19 
 
 
434 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  38.52 
 
 
433 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  37.98 
 
 
435 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  37.84 
 
 
436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  43.67 
 
 
443 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  43.26 
 
 
439 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  38.8 
 
 
447 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
439 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  39.75 
 
 
434 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2267  histidine kinase  41.58 
 
 
472 aa  276  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  38 
 
 
438 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1146  histidine kinase A domain protein  51.65 
 
 
310 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.425134  normal  0.0737136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  37.76 
 
 
438 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.76 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  38 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  44.2 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  38.21 
 
 
431 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  38.21 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  36.79 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  38.21 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  36.72 
 
 
431 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  40.67 
 
 
438 aa  266  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  36.72 
 
 
431 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  36.72 
 
 
431 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  38.21 
 
 
431 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
435 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  36.72 
 
 
431 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  40.93 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
435 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  36.49 
 
 
431 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  36.49 
 
 
431 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  39.51 
 
 
432 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  36.49 
 
 
431 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
435 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  36.49 
 
 
431 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  36.49 
 
 
431 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
440 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
435 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.825444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>