More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0876 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 477 aa  963    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  98.94 
 
 		 472 aa  937    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 477 aa  963    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  71.82 
 
 		 472 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  59.79 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  59.15 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  59.15 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  58.07 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  58.07 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  58.07 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  58.07 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  58.07 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  58.07 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  57.86 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  58.07 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  57.86 
 
 		 474 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  59.79 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  49.79 
 
 		 483 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  49.58 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  49.79 
 
 		 483 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  49.79 
 
 		 483 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  49.48 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  47.61 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  48.84 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  46.93 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  47.15 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  45.76 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  45.45 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  45.23 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  45.55 
 
 		 478 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  43.13 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.1 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  44.86 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  40.46 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  40.72 
 
 		 478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  43.41 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  39.63 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 476 aa  322  7e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  41.13 
 
 		 477 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  40.37 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  38.34 
 
 		 486 aa  302  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  38.22 
 
 		 494 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  32.74 
 
 		 628 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  38.17 
 
 		 239 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.07 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  34 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 815 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 614 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  31.33 
 
 		 571 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.33 
 
 		 571 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.2 
 
 		 486 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.45 
 
 		 584 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.29 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  31.08 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  28.7 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  31.96 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 592 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  34.39 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 639 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 494 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.46 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 494 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 537 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.82 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 639 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  23.38 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.76 
 
 		 468 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  33.79 
 
 		 347 aa  117  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  28.49 
 
 		 616 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 584 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  28.49 
 
 		 616 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 473 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.96 
 
 		 392 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25.8 
 
 		 508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>