More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2826 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 453 aa  919    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2562  histidine kinase  38.1 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 467 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.89 
 
 		 556 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 458 aa  219  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  43.84 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  41.56 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 594 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 599 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 815 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 608 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  41.6 
 
 		 598 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  38.79 
 
 		 257 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  41.41 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 589 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  31.55 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 600 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  40 
 
 		 591 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  38.7 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  35.93 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  41.45 
 
 		 575 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  35.93 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 412 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 470 aa  170  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 607 aa  170  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  33.65 
 
 		 466 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.12 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  36.84 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.34 
 
 		 537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  35.5 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 459 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1223  histidine kinase  38.98 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0457271  hitchhiker  0.00161967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  35.37 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  42.11 
 
 		 571 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 596 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  38.46 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  35 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  33.44 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  40.09 
 
 		 252 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  40 
 
 		 565 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 585 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 585 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 585 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 515 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  38.22 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  33.66 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 589 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1373  histidine kinase  38.18 
 
 		 541 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000714338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  34.94 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.44 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  35.65 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  39.65 
 
 		 252 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  36.75 
 
 		 347 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 609 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  37.25 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  38.79 
 
 		 412 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>