More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3598 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  98.31 
 
 		 474 aa  942    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  98.95 
 
 		 474 aa  949    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  100 
 
 		 474 aa  962    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  80.59 
 
 		 474 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 		 474 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  97.89 
 
 		 474 aa  939    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  98.52 
 
 		 474 aa  944    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  80.59 
 
 		 474 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  73.21 
 
 		 474 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  98.31 
 
 		 474 aa  942    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  98.52 
 
 		 474 aa  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  80.17 
 
 		 474 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  98.95 
 
 		 474 aa  949    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  98.1 
 
 		 474 aa  939    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  80.59 
 
 		 474 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  62.55 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  57.86 
 
 		 477 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  57.86 
 
 		 477 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  58.3 
 
 		 472 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  50.85 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  46.68 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  46.68 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  46.68 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  46.89 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  48.28 
 
 		 474 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  48.1 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  45.7 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  46.03 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  46.11 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  46.95 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  46.33 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  44.7 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  45.19 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  42.64 
 
 		 481 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  43.91 
 
 		 486 aa  356  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  44.42 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.75 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 476 aa  319  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  41.07 
 
 		 477 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  41.74 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  39.54 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  38.3 
 
 		 478 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  36.09 
 
 		 480 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  38.6 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  33.47 
 
 		 628 aa  242  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  42.06 
 
 		 239 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 589 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.5 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  28.73 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 606 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.02 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.59 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  28.01 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  30.53 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  30.79 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.02 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.02 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.02 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.02 
 
 		 587 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 592 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.25 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.32 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.46 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.58 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.7 
 
 		 591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 600 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  25.29 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 639 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 587 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 608 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  27.83 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 639 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>