More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1376 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  100 
 
 
481 aa  975    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  39.92 
 
 
477 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
509 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
469 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.35 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
504 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
469 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
469 aa  236  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  41.16 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.89 
 
 
461 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
469 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.61 
 
 
469 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.49 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
471 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
490 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
459 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
462 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  38.59 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.16 
 
 
466 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
438 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.61 
 
 
466 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
452 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
384 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
406 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34 
 
 
471 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
515 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  27.66 
 
 
457 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  27.66 
 
 
457 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
460 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
476 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  31.99 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  34.32 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  35.2 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.02 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  38.41 
 
 
475 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
403 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
543 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
498 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.69 
 
 
457 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.2 
 
 
471 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
534 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.06 
 
 
477 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  31.2 
 
 
470 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
513 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
479 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
504 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
513 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
479 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
478 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  28.74 
 
 
443 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.5 
 
 
472 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
445 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  37.25 
 
 
592 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  30 
 
 
468 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  26.8 
 
 
471 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  34.25 
 
 
494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
524 aa  166  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  29.25 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  30.53 
 
 
504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  27.27 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
457 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  40.68 
 
 
429 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  30.64 
 
 
498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  30.43 
 
 
436 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
478 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  30.43 
 
 
436 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.44 
 
 
471 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  35.02 
 
 
477 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
482 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
488 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  28.07 
 
 
457 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  30.79 
 
 
473 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  36.75 
 
 
492 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
365 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
470 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
416 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3266  histidine kinase  28.25 
 
 
476 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
465 aa  160  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.7 
 
 
310 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
392 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
416 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
537 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
416 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
490 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
482 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
515 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
535 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.72 
 
 
449 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
515 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  38.49 
 
 
555 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>