More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0016 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 479 aa  979    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  48.97 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  38.49 
 
 		 494 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  40.44 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00270  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  37.33 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.63 
 
 		 477 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1045  histidine kinase  31.93 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  37.11 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  35.95 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 491 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.11 
 
 		 481 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  35.77 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  30.45 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.81 
 
 		 592 aa  168  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 416 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 416 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  36.18 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  34.38 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  29.28 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  33.45 
 
 		 456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.69 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  38.43 
 
 		 416 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  30.09 
 
 		 501 aa  160  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  37.12 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  37.99 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  37.55 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.45 
 
 		 555 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 429 aa  157  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.48 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.1 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  37.12 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1333  histidine kinase  36.94 
 
 		 226 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000137869  decreased coverage  0.000238136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 366 aa  154  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  31.48 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  31.15 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  30.82 
 
 		 482 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  32.51 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  30.82 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  30.82 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 585 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 487 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.52 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  30.49 
 
 		 482 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.57 
 
 		 486 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.94 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  32.12 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  31.31 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  35.64 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  29.94 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 600 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.45 
 
 		 469 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  36.44 
 
 		 429 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  30.56 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  34.52 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.52 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.13 
 
 		 587 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  30.77 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>