More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2626 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 406 aa  818    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  38.34 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  40.45 
 
 		 490 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  35.86 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  40.58 
 
 		 592 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  38.61 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  40.13 
 
 		 486 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 504 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  37.62 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 509 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  40.34 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  38.78 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  36.11 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 524 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.16 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  39.32 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 469 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  35.2 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  34.42 
 
 		 497 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  36.45 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 466 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.03 
 
 		 477 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  38.91 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.77 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 495 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  39.48 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 515 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.14 
 
 		 503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  38.18 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  37.67 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  37.67 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  41.2 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  39.91 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 477 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.45 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  36.21 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 723 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  40.17 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  40.77 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  40.77 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 454 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 490 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.9 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  38.13 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  32.79 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  38.7 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 479 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 478 aa  155  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  32.22 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.33 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  31.08 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.63 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 459 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.39 
 
 		 483 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>