More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2297 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  100 
 
 		 467 aa  923    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  68.79 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  59.19 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  52.14 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.99 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  46.15 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  45.66 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  52.25 
 
 		 403 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  45.71 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  45.23 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  47.6 
 
 		 344 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 404 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  45.4 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  44.76 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  41.51 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.94 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  38.11 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  40.51 
 
 		 382 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  36.39 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.76 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  38.36 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 378 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  37.6 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 378 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  37.86 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.84 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.62 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.7 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.09 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.89 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  35.53 
 
 		 455 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  34.97 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.57 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.72 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  29.31 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  36.33 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  34.41 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.86 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 357 aa  133  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  30.23 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>