More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1448 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
524 aa  1030    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
515 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 
474 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
502 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.42 
 
 
460 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
522 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.25 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
532 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
532 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
517 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
545 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  43.73 
 
 
477 aa  263  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  35.84 
 
 
520 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
505 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
535 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.03 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  39.59 
 
 
471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  39.26 
 
 
470 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  40.4 
 
 
483 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  44.69 
 
 
477 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 
601 aa  252  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  49.39 
 
 
487 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.58 
 
 
486 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
529 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
552 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  43.11 
 
 
492 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  48.48 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
473 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  39.65 
 
 
540 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
490 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  38.66 
 
 
485 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  53.36 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  48.62 
 
 
550 aa  240  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  37.94 
 
 
506 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
612 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.54 
 
 
365 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
534 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  43.31 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
468 aa  233  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
635 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
488 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  37.68 
 
 
496 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  35.73 
 
 
559 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  38.2 
 
 
494 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  41.57 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
509 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  39.3 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
504 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  46.39 
 
 
469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  36.09 
 
 
497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
474 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
469 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
509 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
470 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  38.09 
 
 
473 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  33.91 
 
 
648 aa  207  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  38.82 
 
 
477 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  39.47 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
510 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  47.49 
 
 
525 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.1 
 
 
477 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  39.06 
 
 
486 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
459 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
502 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  30.81 
 
 
466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
466 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
466 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
469 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  37.02 
 
 
469 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  31.18 
 
 
466 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  37.85 
 
 
519 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.69 
 
 
490 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  37.27 
 
 
565 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
459 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
473 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  31.41 
 
 
463 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
490 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
452 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  32.74 
 
 
461 aa  176  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
406 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
438 aa  176  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.93 
 
 
468 aa  173  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.29 
 
 
457 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
639 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>