More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1497 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  96.63 
 
 		 389 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  57.33 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  50.72 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 362 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  50 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  44.68 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  42.59 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.62 
 
 		 448 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  43.73 
 
 		 413 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  40.1 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  41.01 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  42.71 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.99 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  41.35 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.71 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  38.12 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  41 
 
 		 367 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 394 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.66 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  41.55 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  37.79 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  33.96 
 
 		 592 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.27 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  34.31 
 
 		 370 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.97 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.53 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  38.89 
 
 		 478 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  35.04 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  27.11 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 513 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  32.42 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.56 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  31.7 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.77 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.89 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  27.36 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.7 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 463 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 523 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  31.44 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  35.44 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.1 
 
 		 555 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  36.51 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  31.21 
 
 		 477 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.89 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.25 
 
 		 566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  36.3 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  32.16 
 
 		 459 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 504 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.23 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  28.82 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.62 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  30.24 
 
 		 507 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  35.23 
 
 		 523 aa  126  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>