More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2057 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 504 aa  999    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.44 
 
 		 509 aa  862    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  49.38 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.31 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.44 
 
 		 481 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.02 
 
 		 477 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 384 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  41.28 
 
 		 469 aa  213  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3266  histidine kinase  36.23 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  38.6 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 480 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 469 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.15 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  32.31 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  33.56 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.33 
 
 		 497 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.56 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  35.87 
 
 		 494 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.61 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  32.57 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 522 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  30.46 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.85 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  32.16 
 
 		 471 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 365 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 471 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.85 
 
 		 466 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 473 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  38.38 
 
 		 473 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  40.88 
 
 		 480 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 537 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 491 aa  179  7e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 475 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 532 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 532 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  35.56 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  35.46 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 524 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  29.7 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 585 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  35.29 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.64 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  39.74 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  39.74 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 582 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  37.6 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.08 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  37.6 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  39.5 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  32.93 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  35.94 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 457 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  32.58 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.85 
 
 		 587 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 587 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>