More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1987 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 489 aa  1001    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  41.25 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3464  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 480 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.35 
 
 		 468 aa  249  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.84 
 
 		 483 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 486 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  43.31 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  43.31 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  43.31 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  43.31 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  43.31 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  42.96 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  42.61 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  43.31 
 
 		 715 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 474 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  35.58 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  33.55 
 
 		 484 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 475 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  36.68 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 467 aa  229  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 469 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  38.34 
 
 		 463 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.79 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 473 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  37.42 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.93 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 466 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  36.63 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.42 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  34.86 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  36.05 
 
 		 480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  36.78 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  40.58 
 
 		 463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 480 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  34.7 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.42 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  40.58 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  32.17 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 474 aa  210  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 469 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 477 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  37.27 
 
 		 462 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  33.81 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.51 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.11 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.11 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  35.11 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  33.52 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  33.64 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  38.74 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.64 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 465 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.8 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  36.11 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  38.24 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  33.97 
 
 		 491 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>